Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEFHP12036 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEFHP12036 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEFHP12036 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEFHP12036 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEFHP12036 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEFHP12036 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEFHP12036 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEFHP12036 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEFHP12036 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEFHP12036 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEFHP12036 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEFHP12036 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEFHP12036 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEFHP12036 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEFHP12036 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEFHP12036 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEFHP12036 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEFHP12036 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEFHP12036 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEFHP12036 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEFHP12036 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEFHP12036 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEFHP12036 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEFHP12036 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEFHP12036 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEFHP12036 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEFHP12036 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NEFHP12036 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEFHP12036 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEFHP12036 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEFHP12036 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEFHP12036 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NEFHP12036 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEFHP12036 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEFHP12036 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEFHP12036 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEFHP12036 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEFHP12036 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEFHP12036 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEFHP12036 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NEFHP12036 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEFHP12036 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NEFHP12036 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEFHP12036 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEFHP12036 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NEFHP12036 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEFHP12036 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEFHP12036 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEFHP12036 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEFHP12036 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEFHP12036 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEFHP12036 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEFHP12036 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEFHP12036 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEFHP12036 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEFHP12036 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEFHP12036 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEFHP12036 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEFHP12036 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEFHP12036 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEFHP12036 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEFHP12036 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEFHP12036 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEFHP12036 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEFHP12036 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEFHP12036 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEFHP12036 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NEFHP12036 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEFHP12036 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEFHP12036 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NEFHP12036 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NEFHP12036 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEFHP12036 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEFHP12036 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEFHP12036 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEFHP12036 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEFHP12036 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEFHP12036 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEFHP12036 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NEFHP12036 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEFHP12036 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEFHP12036 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEFHP12036 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEFHP12036 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEFHP12036 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEFHP12036 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEFHP12036 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEFHP12036 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEFHP12036 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEFHP12036 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEFHP12036 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEFHP12036 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEFHP12036 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEFHP12036 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEFHP12036 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEFHP12036 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEFHP12036 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEFHP12036 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEFHP12036 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms