Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ODC1P11926 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ODC1P11926 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ODC1P11926 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ODC1P11926 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ODC1P11926 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ODC1P11926 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ODC1P11926 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ODC1P11926 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
ODC1P11926 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ODC1P11926 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ODC1P11926 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ODC1P11926 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ODC1P11926 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ODC1P11926 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ODC1P11926 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ODC1P11926 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ODC1P11926 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ODC1P11926 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ODC1P11926 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ODC1P11926 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ODC1P11926 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ODC1P11926 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ODC1P11926 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ODC1P11926 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ODC1P11926 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ODC1P11926 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ODC1P11926 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ODC1P11926 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ODC1P11926 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ODC1P11926 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ODC1P11926 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ODC1P11926 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ODC1P11926 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ODC1P11926 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ODC1P11926 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ODC1P11926 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ODC1P11926 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ODC1P11926 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ODC1P11926 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ODC1P11926 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ODC1P11926 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ODC1P11926 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ODC1P11926 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ODC1P11926 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ODC1P11926 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ODC1P11926 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ODC1P11926 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ODC1P11926 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ODC1P11926 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ODC1P11926 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ODC1P11926 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ODC1P11926 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ODC1P11926 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ODC1P11926 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ODC1P11926 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ODC1P11926 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ODC1P11926 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ODC1P11926 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ODC1P11926 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ODC1P11926 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ODC1P11926 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ODC1P11926 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ODC1P11926 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ODC1P11926 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ODC1P11926 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ODC1P11926 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ODC1P11926 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ODC1P11926 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ODC1P11926 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ODC1P11926 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ODC1P11926 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ODC1P11926 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ODC1P11926 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ODC1P11926 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ODC1P11926 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ODC1P11926 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ODC1P11926 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ODC1P11926 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ODC1P11926 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ODC1P11926 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ODC1P11926 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ODC1P11926 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ODC1P11926 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ODC1P11926 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ODC1P11926 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ODC1P11926 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ODC1P11926 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ODC1P11926 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ODC1P11926 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ODC1P11926 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ODC1P11926 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ODC1P11926 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ODC1P11926 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ODC1P11926 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ODC1P11926 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ODC1P11926 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ODC1P11926 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ODC1P11926 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ODC1P11926 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms