Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CHGAP10645 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CHGAP10645 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CHGAP10645 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CHGAP10645 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CHGAP10645 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CHGAP10645 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CHGAP10645 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CHGAP10645 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CHGAP10645 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CHGAP10645 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CHGAP10645 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CHGAP10645 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHGAP10645 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHGAP10645 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHGAP10645 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHGAP10645 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHGAP10645 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHGAP10645 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHGAP10645 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHGAP10645 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHGAP10645 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHGAP10645 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHGAP10645 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CHGAP10645 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CHGAP10645 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CHGAP10645 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CHGAP10645 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CHGAP10645 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CHGAP10645 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CHGAP10645 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CHGAP10645 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CHGAP10645 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CHGAP10645 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CHGAP10645 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CHGAP10645 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CHGAP10645 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CHGAP10645 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CHGAP10645 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CHGAP10645 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CHGAP10645 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CHGAP10645 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CHGAP10645 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CHGAP10645 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CHGAP10645 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CHGAP10645 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CHGAP10645 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CHGAP10645 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CHGAP10645 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CHGAP10645 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CHGAP10645 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CHGAP10645 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CHGAP10645 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CHGAP10645 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CHGAP10645 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CHGAP10645 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CHGAP10645 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CHGAP10645 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CHGAP10645 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CHGAP10645 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CHGAP10645 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CHGAP10645 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CHGAP10645 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CHGAP10645 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CHGAP10645 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CHGAP10645 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CHGAP10645 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CHGAP10645 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CHGAP10645 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CHGAP10645 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CHGAP10645 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CHGAP10645 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CHGAP10645 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CHGAP10645 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CHGAP10645 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CHGAP10645 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CHGAP10645 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CHGAP10645 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CHGAP10645 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CHGAP10645 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CHGAP10645 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CHGAP10645 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CHGAP10645 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CHGAP10645 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CHGAP10645 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CHGAP10645 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CHGAP10645 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CHGAP10645 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CHGAP10645 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CHGAP10645 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CHGAP10645 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CHGAP10645 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CHGAP10645 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CHGAP10645 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CHGAP10645 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CHGAP10645 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CHGAP10645 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CHGAP10645 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CHGAP10645 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CHGAP10645 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms