Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GLI3P10071 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GLI3P10071 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GLI3P10071 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GLI3P10071 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GLI3P10071 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
GLI3P10071 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
GLI3P10071 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GLI3P10071 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GLI3P10071 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GLI3P10071 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GLI3P10071 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GLI3P10071 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
GLI3P10071 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GLI3P10071 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GLI3P10071 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GLI3P10071 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GLI3P10071 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GLI3P10071 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GLI3P10071 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GLI3P10071 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GLI3P10071 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GLI3P10071 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GLI3P10071 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GLI3P10071 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GLI3P10071 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GLI3P10071 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GLI3P10071 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GLI3P10071 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GLI3P10071 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GLI3P10071 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GLI3P10071 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
GLI3P10071 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GLI3P10071 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GLI3P10071 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GLI3P10071 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GLI3P10071 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GLI3P10071 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
GLI3P10071 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GLI3P10071 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GLI3P10071 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GLI3P10071 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GLI3P10071 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GLI3P10071 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GLI3P10071 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GLI3P10071 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
GLI3P10071 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GLI3P10071 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GLI3P10071 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GLI3P10071 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GLI3P10071 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GLI3P10071 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
GLI3P10071 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GLI3P10071 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GLI3P10071 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GLI3P10071 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GLI3P10071 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
GLI3P10071 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GLI3P10071 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GLI3P10071 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
GLI3P10071 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GLI3P10071 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GLI3P10071 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GLI3P10071 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GLI3P10071 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GLI3P10071 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GLI3P10071 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GLI3P10071 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GLI3P10071 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GLI3P10071 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GLI3P10071 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GLI3P10071 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GLI3P10071 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GLI3P10071 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GLI3P10071 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GLI3P10071 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GLI3P10071 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GLI3P10071 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GLI3P10071 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GLI3P10071 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
GLI3P10071 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GLI3P10071 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GLI3P10071 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GLI3P10071 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GLI3P10071 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GLI3P10071 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GLI3P10071 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GLI3P10071 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GLI3P10071 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GLI3P10071 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GLI3P10071 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GLI3P10071 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GLI3P10071 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GLI3P10071 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GLI3P10071 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GLI3P10071 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GLI3P10071 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GLI3P10071 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GLI3P10071 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GLI3P10071 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms