Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms