Protein–RNA interactions for Protein: P0DJJ0

SRGAP2C, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2CP0DJJ0 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRGAP2CP0DJJ0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRGAP2CP0DJJ0 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRGAP2CP0DJJ0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRGAP2CP0DJJ0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SRGAP2CP0DJJ0 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SRGAP2CP0DJJ0 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRGAP2CP0DJJ0 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRGAP2CP0DJJ0 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SRGAP2CP0DJJ0 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRGAP2CP0DJJ0 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SRGAP2CP0DJJ0 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SRGAP2CP0DJJ0 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SRGAP2CP0DJJ0 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SRGAP2CP0DJJ0 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SRGAP2CP0DJJ0 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SRGAP2CP0DJJ0 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SRGAP2CP0DJJ0 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SRGAP2CP0DJJ0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SRGAP2CP0DJJ0 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRGAP2CP0DJJ0 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRGAP2CP0DJJ0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRGAP2CP0DJJ0 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SRGAP2CP0DJJ0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRGAP2CP0DJJ0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRGAP2CP0DJJ0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRGAP2CP0DJJ0 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRGAP2CP0DJJ0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRGAP2CP0DJJ0 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRGAP2CP0DJJ0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRGAP2CP0DJJ0 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRGAP2CP0DJJ0 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRGAP2CP0DJJ0 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRGAP2CP0DJJ0 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRGAP2CP0DJJ0 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SRGAP2CP0DJJ0 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRGAP2CP0DJJ0 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRGAP2CP0DJJ0 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SRGAP2CP0DJJ0 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRGAP2CP0DJJ0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRGAP2CP0DJJ0 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRGAP2CP0DJJ0 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRGAP2CP0DJJ0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRGAP2CP0DJJ0 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRGAP2CP0DJJ0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRGAP2CP0DJJ0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRGAP2CP0DJJ0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRGAP2CP0DJJ0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRGAP2CP0DJJ0 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRGAP2CP0DJJ0 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRGAP2CP0DJJ0 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRGAP2CP0DJJ0 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRGAP2CP0DJJ0 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRGAP2CP0DJJ0 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SRGAP2CP0DJJ0 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRGAP2CP0DJJ0 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRGAP2CP0DJJ0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRGAP2CP0DJJ0 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRGAP2CP0DJJ0 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRGAP2CP0DJJ0 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRGAP2CP0DJJ0 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRGAP2CP0DJJ0 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRGAP2CP0DJJ0 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRGAP2CP0DJJ0 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRGAP2CP0DJJ0 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRGAP2CP0DJJ0 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRGAP2CP0DJJ0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRGAP2CP0DJJ0 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRGAP2CP0DJJ0 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRGAP2CP0DJJ0 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRGAP2CP0DJJ0 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRGAP2CP0DJJ0 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRGAP2CP0DJJ0 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SRGAP2CP0DJJ0 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRGAP2CP0DJJ0 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRGAP2CP0DJJ0 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRGAP2CP0DJJ0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRGAP2CP0DJJ0 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRGAP2CP0DJJ0 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRGAP2CP0DJJ0 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRGAP2CP0DJJ0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRGAP2CP0DJJ0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRGAP2CP0DJJ0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRGAP2CP0DJJ0 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRGAP2CP0DJJ0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRGAP2CP0DJJ0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRGAP2CP0DJJ0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRGAP2CP0DJJ0 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRGAP2CP0DJJ0 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRGAP2CP0DJJ0 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRGAP2CP0DJJ0 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRGAP2CP0DJJ0 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRGAP2CP0DJJ0 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SRGAP2CP0DJJ0 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRGAP2CP0DJJ0 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRGAP2CP0DJJ0 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRGAP2CP0DJJ0 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SRGAP2CP0DJJ0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SRGAP2CP0DJJ0 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SRGAP2CP0DJJ0 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms