Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W0

PRR29, Proline-rich protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR29P0C7W0 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 YIPF7-202ENST00000415895 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 ATP6V1G1-201ENST00000374050 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms