Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L4

C4A, Complement C4-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4AP0C0L4 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C4AP0C0L4 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
C4AP0C0L4 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C4AP0C0L4 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C4AP0C0L4 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C4AP0C0L4 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C4AP0C0L4 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C4AP0C0L4 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C4AP0C0L4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C4AP0C0L4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C4AP0C0L4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C4AP0C0L4 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C4AP0C0L4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C4AP0C0L4 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
C4AP0C0L4 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
C4AP0C0L4 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C4AP0C0L4 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
C4AP0C0L4 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C4AP0C0L4 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
C4AP0C0L4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C4AP0C0L4 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C4AP0C0L4 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C4AP0C0L4 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C4AP0C0L4 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C4AP0C0L4 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
C4AP0C0L4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C4AP0C0L4 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C4AP0C0L4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C4AP0C0L4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C4AP0C0L4 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C4AP0C0L4 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C4AP0C0L4 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C4AP0C0L4 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C4AP0C0L4 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C4AP0C0L4 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C4AP0C0L4 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C4AP0C0L4 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
C4AP0C0L4 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C4AP0C0L4 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
C4AP0C0L4 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C4AP0C0L4 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C4AP0C0L4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C4AP0C0L4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C4AP0C0L4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
C4AP0C0L4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
C4AP0C0L4 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
C4AP0C0L4 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C4AP0C0L4 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
C4AP0C0L4 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
C4AP0C0L4 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
C4AP0C0L4 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
C4AP0C0L4 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
C4AP0C0L4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C4AP0C0L4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C4AP0C0L4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C4AP0C0L4 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
C4AP0C0L4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C4AP0C0L4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
C4AP0C0L4 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
C4AP0C0L4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C4AP0C0L4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C4AP0C0L4 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C4AP0C0L4 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C4AP0C0L4 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
C4AP0C0L4 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
C4AP0C0L4 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C4AP0C0L4 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C4AP0C0L4 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C4AP0C0L4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C4AP0C0L4 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C4AP0C0L4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
C4AP0C0L4 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C4AP0C0L4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C4AP0C0L4 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C4AP0C0L4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C4AP0C0L4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C4AP0C0L4 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C4AP0C0L4 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C4AP0C0L4 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C4AP0C0L4 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C4AP0C0L4 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C4AP0C0L4 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C4AP0C0L4 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C4AP0C0L4 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C4AP0C0L4 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C4AP0C0L4 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
C4AP0C0L4 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C4AP0C0L4 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C4AP0C0L4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C4AP0C0L4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C4AP0C0L4 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C4AP0C0L4 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C4AP0C0L4 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
C4AP0C0L4 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C4AP0C0L4 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C4AP0C0L4 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C4AP0C0L4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C4AP0C0L4 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C4AP0C0L4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C4AP0C0L4 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms