Protein–RNA interactions for Protein: P09496

CLTA, Clathrin light chain A, humanhuman

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTAP09496 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLTAP09496 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLTAP09496 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLTAP09496 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLTAP09496 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLTAP09496 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLTAP09496 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLTAP09496 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLTAP09496 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLTAP09496 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLTAP09496 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLTAP09496 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLTAP09496 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLTAP09496 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLTAP09496 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CLTAP09496 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLTAP09496 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLTAP09496 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLTAP09496 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLTAP09496 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLTAP09496 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
CLTAP09496 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLTAP09496 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLTAP09496 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLTAP09496 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLTAP09496 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLTAP09496 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLTAP09496 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CLTAP09496 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CLTAP09496 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLTAP09496 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLTAP09496 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLTAP09496 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLTAP09496 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLTAP09496 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLTAP09496 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLTAP09496 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLTAP09496 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLTAP09496 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CLTAP09496 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CLTAP09496 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLTAP09496 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLTAP09496 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CLTAP09496 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLTAP09496 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLTAP09496 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLTAP09496 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLTAP09496 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLTAP09496 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLTAP09496 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLTAP09496 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLTAP09496 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLTAP09496 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLTAP09496 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLTAP09496 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLTAP09496 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLTAP09496 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLTAP09496 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLTAP09496 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLTAP09496 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CLTAP09496 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLTAP09496 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLTAP09496 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLTAP09496 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLTAP09496 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CLTAP09496 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CLTAP09496 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLTAP09496 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLTAP09496 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLTAP09496 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLTAP09496 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLTAP09496 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLTAP09496 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLTAP09496 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLTAP09496 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLTAP09496 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLTAP09496 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLTAP09496 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLTAP09496 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLTAP09496 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLTAP09496 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLTAP09496 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLTAP09496 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLTAP09496 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLTAP09496 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLTAP09496 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CLTAP09496 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CLTAP09496 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLTAP09496 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLTAP09496 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLTAP09496 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLTAP09496 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLTAP09496 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CLTAP09496 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLTAP09496 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CLTAP09496 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLTAP09496 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLTAP09496 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLTAP09496 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CLTAP09496 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
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