Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms