Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CENPBP07199 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CENPBP07199 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CENPBP07199 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CENPBP07199 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CENPBP07199 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CENPBP07199 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CENPBP07199 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CENPBP07199 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CENPBP07199 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CENPBP07199 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CENPBP07199 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CENPBP07199 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CENPBP07199 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CENPBP07199 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CENPBP07199 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CENPBP07199 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CENPBP07199 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CENPBP07199 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CENPBP07199 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CENPBP07199 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CENPBP07199 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CENPBP07199 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CENPBP07199 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CENPBP07199 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CENPBP07199 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CENPBP07199 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CENPBP07199 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CENPBP07199 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CENPBP07199 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CENPBP07199 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CENPBP07199 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CENPBP07199 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CENPBP07199 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CENPBP07199 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CENPBP07199 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CENPBP07199 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CENPBP07199 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CENPBP07199 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CENPBP07199 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CENPBP07199 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CENPBP07199 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CENPBP07199 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CENPBP07199 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CENPBP07199 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CENPBP07199 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CENPBP07199 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CENPBP07199 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CENPBP07199 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CENPBP07199 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CENPBP07199 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CENPBP07199 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CENPBP07199 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CENPBP07199 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CENPBP07199 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CENPBP07199 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CENPBP07199 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CENPBP07199 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CENPBP07199 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CENPBP07199 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CENPBP07199 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CENPBP07199 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CENPBP07199 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CENPBP07199 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CENPBP07199 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CENPBP07199 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CENPBP07199 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CENPBP07199 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CENPBP07199 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CENPBP07199 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CENPBP07199 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CENPBP07199 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CENPBP07199 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CENPBP07199 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CENPBP07199 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CENPBP07199 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CENPBP07199 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CENPBP07199 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CENPBP07199 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CENPBP07199 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CENPBP07199 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CENPBP07199 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CENPBP07199 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CENPBP07199 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CENPBP07199 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CENPBP07199 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CENPBP07199 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CENPBP07199 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CENPBP07199 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CENPBP07199 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CENPBP07199 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CENPBP07199 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CENPBP07199 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CENPBP07199 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CENPBP07199 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CENPBP07199 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CENPBP07199 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CENPBP07199 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CENPBP07199 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CENPBP07199 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms