Protein–RNA interactions for Protein: O95985

TOP3B, DNA topoisomerase 3-beta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BO95985 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TOP3BO95985 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TOP3BO95985 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TOP3BO95985 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TOP3BO95985 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TOP3BO95985 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TOP3BO95985 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TOP3BO95985 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TOP3BO95985 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TOP3BO95985 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TOP3BO95985 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TOP3BO95985 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TOP3BO95985 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TOP3BO95985 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TOP3BO95985 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TOP3BO95985 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TOP3BO95985 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TOP3BO95985 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TOP3BO95985 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TOP3BO95985 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TOP3BO95985 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TOP3BO95985 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TOP3BO95985 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TOP3BO95985 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TOP3BO95985 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TOP3BO95985 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TOP3BO95985 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TOP3BO95985 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TOP3BO95985 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TOP3BO95985 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TOP3BO95985 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TOP3BO95985 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TOP3BO95985 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TOP3BO95985 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TOP3BO95985 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TOP3BO95985 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TOP3BO95985 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TOP3BO95985 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TOP3BO95985 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TOP3BO95985 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TOP3BO95985 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TOP3BO95985 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TOP3BO95985 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TOP3BO95985 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TOP3BO95985 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TOP3BO95985 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TOP3BO95985 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TOP3BO95985 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TOP3BO95985 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TOP3BO95985 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TOP3BO95985 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TOP3BO95985 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TOP3BO95985 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TOP3BO95985 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TOP3BO95985 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TOP3BO95985 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TOP3BO95985 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TOP3BO95985 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TOP3BO95985 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TOP3BO95985 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TOP3BO95985 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TOP3BO95985 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TOP3BO95985 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TOP3BO95985 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TOP3BO95985 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TOP3BO95985 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TOP3BO95985 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TOP3BO95985 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TOP3BO95985 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TOP3BO95985 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TOP3BO95985 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TOP3BO95985 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TOP3BO95985 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TOP3BO95985 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TOP3BO95985 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TOP3BO95985 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TOP3BO95985 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TOP3BO95985 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TOP3BO95985 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TOP3BO95985 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TOP3BO95985 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TOP3BO95985 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TOP3BO95985 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TOP3BO95985 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TOP3BO95985 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TOP3BO95985 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TOP3BO95985 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TOP3BO95985 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TOP3BO95985 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TOP3BO95985 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TOP3BO95985 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TOP3BO95985 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TOP3BO95985 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TOP3BO95985 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TOP3BO95985 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TOP3BO95985 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TOP3BO95985 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TOP3BO95985 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TOP3BO95985 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TOP3BO95985 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms