Protein–RNA interactions for Protein: O75676

RPS6KA4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA4O75676 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPS6KA4O75676 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPS6KA4O75676 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPS6KA4O75676 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPS6KA4O75676 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPS6KA4O75676 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPS6KA4O75676 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPS6KA4O75676 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPS6KA4O75676 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RPS6KA4O75676 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPS6KA4O75676 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPS6KA4O75676 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPS6KA4O75676 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPS6KA4O75676 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPS6KA4O75676 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPS6KA4O75676 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPS6KA4O75676 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPS6KA4O75676 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RPS6KA4O75676 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPS6KA4O75676 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPS6KA4O75676 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPS6KA4O75676 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPS6KA4O75676 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPS6KA4O75676 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPS6KA4O75676 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPS6KA4O75676 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPS6KA4O75676 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPS6KA4O75676 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPS6KA4O75676 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPS6KA4O75676 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPS6KA4O75676 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPS6KA4O75676 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPS6KA4O75676 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPS6KA4O75676 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPS6KA4O75676 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPS6KA4O75676 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPS6KA4O75676 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RPS6KA4O75676 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPS6KA4O75676 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RPS6KA4O75676 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPS6KA4O75676 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPS6KA4O75676 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPS6KA4O75676 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPS6KA4O75676 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPS6KA4O75676 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPS6KA4O75676 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPS6KA4O75676 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPS6KA4O75676 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RPS6KA4O75676 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPS6KA4O75676 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPS6KA4O75676 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPS6KA4O75676 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPS6KA4O75676 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPS6KA4O75676 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RPS6KA4O75676 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPS6KA4O75676 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPS6KA4O75676 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPS6KA4O75676 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPS6KA4O75676 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPS6KA4O75676 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPS6KA4O75676 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPS6KA4O75676 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPS6KA4O75676 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPS6KA4O75676 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPS6KA4O75676 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPS6KA4O75676 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RPS6KA4O75676 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPS6KA4O75676 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RPS6KA4O75676 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPS6KA4O75676 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPS6KA4O75676 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPS6KA4O75676 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPS6KA4O75676 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPS6KA4O75676 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPS6KA4O75676 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPS6KA4O75676 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPS6KA4O75676 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPS6KA4O75676 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPS6KA4O75676 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPS6KA4O75676 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPS6KA4O75676 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RPS6KA4O75676 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RPS6KA4O75676 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RPS6KA4O75676 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPS6KA4O75676 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPS6KA4O75676 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPS6KA4O75676 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPS6KA4O75676 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPS6KA4O75676 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPS6KA4O75676 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPS6KA4O75676 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPS6KA4O75676 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPS6KA4O75676 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPS6KA4O75676 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPS6KA4O75676 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPS6KA4O75676 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RPS6KA4O75676 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPS6KA4O75676 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPS6KA4O75676 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPS6KA4O75676 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms