Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F6O75461 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F6O75461 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F6O75461 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F6O75461 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F6O75461 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F6O75461 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F6O75461 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F6O75461 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F6O75461 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F6O75461 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F6O75461 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F6O75461 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F6O75461 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F6O75461 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F6O75461 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F6O75461 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F6O75461 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F6O75461 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F6O75461 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F6O75461 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F6O75461 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F6O75461 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F6O75461 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F6O75461 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F6O75461 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F6O75461 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F6O75461 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F6O75461 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F6O75461 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F6O75461 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F6O75461 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F6O75461 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F6O75461 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F6O75461 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F6O75461 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F6O75461 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F6O75461 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F6O75461 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F6O75461 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F6O75461 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F6O75461 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F6O75461 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F6O75461 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F6O75461 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F6O75461 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F6O75461 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F6O75461 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F6O75461 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F6O75461 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F6O75461 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F6O75461 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
E2F6O75461 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
E2F6O75461 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
E2F6O75461 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
E2F6O75461 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F6O75461 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F6O75461 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F6O75461 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F6O75461 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F6O75461 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F6O75461 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F6O75461 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F6O75461 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F6O75461 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F6O75461 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F6O75461 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F6O75461 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F6O75461 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F6O75461 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F6O75461 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F6O75461 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F6O75461 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F6O75461 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F6O75461 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F6O75461 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F6O75461 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F6O75461 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F6O75461 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F6O75461 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F6O75461 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F6O75461 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F6O75461 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F6O75461 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F6O75461 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F6O75461 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F6O75461 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F6O75461 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F6O75461 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F6O75461 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F6O75461 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F6O75461 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F6O75461 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F6O75461 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F6O75461 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F6O75461 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F6O75461 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F6O75461 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F6O75461 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F6O75461 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms