Protein–RNA interactions for Protein: O75446

SAP30, Histone deacetylase complex subunit SAP30, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAP30O75446 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAP30O75446 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAP30O75446 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAP30O75446 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAP30O75446 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAP30O75446 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAP30O75446 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAP30O75446 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAP30O75446 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAP30O75446 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAP30O75446 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAP30O75446 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAP30O75446 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAP30O75446 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAP30O75446 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAP30O75446 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAP30O75446 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAP30O75446 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SAP30O75446 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAP30O75446 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SAP30O75446 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAP30O75446 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAP30O75446 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAP30O75446 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAP30O75446 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAP30O75446 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAP30O75446 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAP30O75446 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAP30O75446 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAP30O75446 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAP30O75446 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SAP30O75446 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
SAP30O75446 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SAP30O75446 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SAP30O75446 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SAP30O75446 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SAP30O75446 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SAP30O75446 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAP30O75446 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAP30O75446 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAP30O75446 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAP30O75446 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAP30O75446 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAP30O75446 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAP30O75446 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAP30O75446 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAP30O75446 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAP30O75446 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAP30O75446 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAP30O75446 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SAP30O75446 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAP30O75446 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAP30O75446 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAP30O75446 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAP30O75446 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SAP30O75446 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAP30O75446 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAP30O75446 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAP30O75446 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAP30O75446 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SAP30O75446 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAP30O75446 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAP30O75446 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SAP30O75446 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SAP30O75446 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAP30O75446 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAP30O75446 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAP30O75446 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAP30O75446 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAP30O75446 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAP30O75446 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAP30O75446 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAP30O75446 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAP30O75446 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAP30O75446 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAP30O75446 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAP30O75446 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAP30O75446 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAP30O75446 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAP30O75446 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAP30O75446 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAP30O75446 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAP30O75446 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAP30O75446 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAP30O75446 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAP30O75446 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAP30O75446 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAP30O75446 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAP30O75446 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAP30O75446 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAP30O75446 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAP30O75446 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAP30O75446 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAP30O75446 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAP30O75446 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAP30O75446 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAP30O75446 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAP30O75446 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAP30O75446 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAP30O75446 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms