Protein–RNA interactions for Protein: O60934

NBN, Nibrin, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBNO60934 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NBNO60934 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NBNO60934 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NBNO60934 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NBNO60934 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NBNO60934 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NBNO60934 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NBNO60934 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NBNO60934 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NBNO60934 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NBNO60934 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NBNO60934 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NBNO60934 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NBNO60934 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NBNO60934 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NBNO60934 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NBNO60934 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NBNO60934 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NBNO60934 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NBNO60934 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NBNO60934 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NBNO60934 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NBNO60934 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NBNO60934 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NBNO60934 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NBNO60934 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NBNO60934 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NBNO60934 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NBNO60934 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NBNO60934 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NBNO60934 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NBNO60934 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NBNO60934 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NBNO60934 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NBNO60934 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NBNO60934 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NBNO60934 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NBNO60934 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NBNO60934 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NBNO60934 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NBNO60934 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NBNO60934 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NBNO60934 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NBNO60934 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NBNO60934 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NBNO60934 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NBNO60934 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NBNO60934 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NBNO60934 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
NBNO60934 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NBNO60934 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NBNO60934 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NBNO60934 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NBNO60934 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NBNO60934 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NBNO60934 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NBNO60934 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NBNO60934 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NBNO60934 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NBNO60934 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NBNO60934 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NBNO60934 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NBNO60934 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NBNO60934 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NBNO60934 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NBNO60934 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NBNO60934 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NBNO60934 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NBNO60934 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NBNO60934 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NBNO60934 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NBNO60934 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NBNO60934 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NBNO60934 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NBNO60934 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NBNO60934 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NBNO60934 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NBNO60934 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NBNO60934 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NBNO60934 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NBNO60934 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NBNO60934 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NBNO60934 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NBNO60934 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NBNO60934 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NBNO60934 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NBNO60934 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NBNO60934 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NBNO60934 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NBNO60934 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NBNO60934 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NBNO60934 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NBNO60934 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NBNO60934 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NBNO60934 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NBNO60934 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NBNO60934 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NBNO60934 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NBNO60934 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NBNO60934 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
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