Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTSVO60911 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTSVO60911 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTSVO60911 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTSVO60911 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTSVO60911 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTSVO60911 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTSVO60911 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTSVO60911 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CTSVO60911 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTSVO60911 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTSVO60911 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTSVO60911 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTSVO60911 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTSVO60911 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTSVO60911 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTSVO60911 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTSVO60911 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTSVO60911 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTSVO60911 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTSVO60911 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CTSVO60911 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTSVO60911 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTSVO60911 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CTSVO60911 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTSVO60911 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTSVO60911 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTSVO60911 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTSVO60911 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTSVO60911 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTSVO60911 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTSVO60911 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTSVO60911 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTSVO60911 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTSVO60911 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTSVO60911 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTSVO60911 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTSVO60911 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTSVO60911 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTSVO60911 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTSVO60911 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTSVO60911 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CTSVO60911 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTSVO60911 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTSVO60911 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTSVO60911 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTSVO60911 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTSVO60911 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTSVO60911 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTSVO60911 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTSVO60911 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTSVO60911 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTSVO60911 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTSVO60911 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTSVO60911 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTSVO60911 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTSVO60911 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTSVO60911 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTSVO60911 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTSVO60911 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTSVO60911 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTSVO60911 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTSVO60911 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTSVO60911 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTSVO60911 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTSVO60911 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTSVO60911 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTSVO60911 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTSVO60911 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTSVO60911 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTSVO60911 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTSVO60911 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTSVO60911 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTSVO60911 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTSVO60911 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTSVO60911 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTSVO60911 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CTSVO60911 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTSVO60911 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTSVO60911 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTSVO60911 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTSVO60911 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTSVO60911 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTSVO60911 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTSVO60911 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTSVO60911 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTSVO60911 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTSVO60911 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTSVO60911 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTSVO60911 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTSVO60911 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTSVO60911 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTSVO60911 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTSVO60911 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTSVO60911 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTSVO60911 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTSVO60911 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTSVO60911 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTSVO60911 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTSVO60911 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms