Protein–RNA interactions for Protein: O60337

MARCH6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH6O60337 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MARCH6O60337 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms