Protein–RNA interactions for Protein: O60231

DHX16, Putative pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,041 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX16O60231 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DHX16O60231 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DHX16O60231 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DHX16O60231 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DHX16O60231 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DHX16O60231 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DHX16O60231 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DHX16O60231 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DHX16O60231 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DHX16O60231 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DHX16O60231 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DHX16O60231 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DHX16O60231 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DHX16O60231 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DHX16O60231 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
DHX16O60231 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DHX16O60231 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DHX16O60231 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DHX16O60231 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
DHX16O60231 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DHX16O60231 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DHX16O60231 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
DHX16O60231 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DHX16O60231 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DHX16O60231 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DHX16O60231 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
DHX16O60231 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
DHX16O60231 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
DHX16O60231 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
DHX16O60231 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DHX16O60231 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DHX16O60231 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DHX16O60231 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DHX16O60231 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DHX16O60231 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DHX16O60231 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DHX16O60231 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DHX16O60231 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DHX16O60231 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DHX16O60231 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DHX16O60231 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DHX16O60231 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DHX16O60231 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DHX16O60231 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DHX16O60231 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DHX16O60231 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DHX16O60231 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DHX16O60231 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DHX16O60231 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DHX16O60231 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DHX16O60231 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DHX16O60231 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DHX16O60231 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DHX16O60231 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DHX16O60231 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DHX16O60231 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DHX16O60231 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DHX16O60231 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DHX16O60231 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DHX16O60231 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DHX16O60231 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DHX16O60231 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DHX16O60231 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DHX16O60231 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DHX16O60231 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DHX16O60231 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DHX16O60231 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DHX16O60231 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DHX16O60231 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DHX16O60231 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DHX16O60231 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DHX16O60231 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DHX16O60231 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DHX16O60231 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DHX16O60231 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DHX16O60231 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DHX16O60231 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DHX16O60231 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DHX16O60231 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
DHX16O60231 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DHX16O60231 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DHX16O60231 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DHX16O60231 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DHX16O60231 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DHX16O60231 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DHX16O60231 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DHX16O60231 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DHX16O60231 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DHX16O60231 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DHX16O60231 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DHX16O60231 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DHX16O60231 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DHX16O60231 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DHX16O60231 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DHX16O60231 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DHX16O60231 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DHX16O60231 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DHX16O60231 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DHX16O60231 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
DHX16O60231 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms