Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms