Protein–RNA interactions for Protein: O43909

EXTL3, Exostosin-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3O43909 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EXTL3O43909 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EXTL3O43909 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EXTL3O43909 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXTL3O43909 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXTL3O43909 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXTL3O43909 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXTL3O43909 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXTL3O43909 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXTL3O43909 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXTL3O43909 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXTL3O43909 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXTL3O43909 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXTL3O43909 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXTL3O43909 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXTL3O43909 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXTL3O43909 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXTL3O43909 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXTL3O43909 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXTL3O43909 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXTL3O43909 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXTL3O43909 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXTL3O43909 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
EXTL3O43909 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
EXTL3O43909 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXTL3O43909 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXTL3O43909 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXTL3O43909 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.07
EXTL3O43909 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EXTL3O43909 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EXTL3O43909 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EXTL3O43909 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EXTL3O43909 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EXTL3O43909 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EXTL3O43909 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EXTL3O43909 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EXTL3O43909 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EXTL3O43909 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EXTL3O43909 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
EXTL3O43909 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
EXTL3O43909 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
EXTL3O43909 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
EXTL3O43909 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EXTL3O43909 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EXTL3O43909 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EXTL3O43909 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EXTL3O43909 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EXTL3O43909 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXTL3O43909 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXTL3O43909 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXTL3O43909 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXTL3O43909 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXTL3O43909 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXTL3O43909 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXTL3O43909 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXTL3O43909 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXTL3O43909 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXTL3O43909 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXTL3O43909 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXTL3O43909 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXTL3O43909 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXTL3O43909 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXTL3O43909 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXTL3O43909 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXTL3O43909 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXTL3O43909 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXTL3O43909 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXTL3O43909 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXTL3O43909 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXTL3O43909 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXTL3O43909 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXTL3O43909 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXTL3O43909 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXTL3O43909 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXTL3O43909 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXTL3O43909 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXTL3O43909 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXTL3O43909 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXTL3O43909 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXTL3O43909 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXTL3O43909 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXTL3O43909 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXTL3O43909 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
EXTL3O43909 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXTL3O43909 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXTL3O43909 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXTL3O43909 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXTL3O43909 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXTL3O43909 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXTL3O43909 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXTL3O43909 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXTL3O43909 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXTL3O43909 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXTL3O43909 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXTL3O43909 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXTL3O43909 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXTL3O43909 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EXTL3O43909 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EXTL3O43909 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EXTL3O43909 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101 ms