Protein–RNA interactions for Protein: O43169

CYB5B, Cytochrome b5 type B, humanhuman

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYB5BO43169 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYB5BO43169 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYB5BO43169 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYB5BO43169 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYB5BO43169 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYB5BO43169 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYB5BO43169 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYB5BO43169 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYB5BO43169 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYB5BO43169 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYB5BO43169 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYB5BO43169 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYB5BO43169 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYB5BO43169 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYB5BO43169 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYB5BO43169 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYB5BO43169 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYB5BO43169 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYB5BO43169 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CYB5BO43169 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYB5BO43169 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYB5BO43169 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYB5BO43169 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYB5BO43169 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYB5BO43169 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYB5BO43169 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYB5BO43169 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYB5BO43169 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYB5BO43169 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYB5BO43169 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYB5BO43169 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYB5BO43169 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYB5BO43169 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYB5BO43169 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYB5BO43169 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CYB5BO43169 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYB5BO43169 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYB5BO43169 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYB5BO43169 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYB5BO43169 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYB5BO43169 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYB5BO43169 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYB5BO43169 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYB5BO43169 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYB5BO43169 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CYB5BO43169 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYB5BO43169 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYB5BO43169 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYB5BO43169 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYB5BO43169 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYB5BO43169 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYB5BO43169 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYB5BO43169 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYB5BO43169 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CYB5BO43169 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYB5BO43169 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYB5BO43169 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYB5BO43169 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYB5BO43169 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYB5BO43169 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYB5BO43169 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYB5BO43169 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYB5BO43169 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYB5BO43169 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYB5BO43169 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYB5BO43169 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYB5BO43169 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYB5BO43169 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYB5BO43169 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CYB5BO43169 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYB5BO43169 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYB5BO43169 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYB5BO43169 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYB5BO43169 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYB5BO43169 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYB5BO43169 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYB5BO43169 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYB5BO43169 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CYB5BO43169 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYB5BO43169 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYB5BO43169 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CYB5BO43169 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYB5BO43169 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYB5BO43169 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYB5BO43169 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYB5BO43169 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYB5BO43169 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYB5BO43169 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYB5BO43169 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYB5BO43169 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYB5BO43169 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYB5BO43169 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYB5BO43169 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYB5BO43169 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYB5BO43169 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYB5BO43169 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYB5BO43169 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYB5BO43169 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CYB5BO43169 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYB5BO43169 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms