Protein–RNA interactions for Protein: O15553

MEFV, Pyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 781 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEFVO15553 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MEFVO15553 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MEFVO15553 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MEFVO15553 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MEFVO15553 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MEFVO15553 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MEFVO15553 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MEFVO15553 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MEFVO15553 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MEFVO15553 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MEFVO15553 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MEFVO15553 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MEFVO15553 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MEFVO15553 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MEFVO15553 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MEFVO15553 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MEFVO15553 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MEFVO15553 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MEFVO15553 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MEFVO15553 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MEFVO15553 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
MEFVO15553 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MEFVO15553 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MEFVO15553 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MEFVO15553 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MEFVO15553 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MEFVO15553 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MEFVO15553 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MEFVO15553 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MEFVO15553 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MEFVO15553 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MEFVO15553 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MEFVO15553 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MEFVO15553 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MEFVO15553 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MEFVO15553 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MEFVO15553 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MEFVO15553 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MEFVO15553 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MEFVO15553 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MEFVO15553 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MEFVO15553 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MEFVO15553 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MEFVO15553 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MEFVO15553 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MEFVO15553 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MEFVO15553 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MEFVO15553 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MEFVO15553 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MEFVO15553 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MEFVO15553 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
MEFVO15553 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MEFVO15553 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MEFVO15553 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MEFVO15553 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MEFVO15553 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MEFVO15553 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MEFVO15553 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MEFVO15553 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MEFVO15553 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MEFVO15553 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MEFVO15553 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MEFVO15553 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MEFVO15553 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MEFVO15553 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MEFVO15553 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MEFVO15553 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
MEFVO15553 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MEFVO15553 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MEFVO15553 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MEFVO15553 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MEFVO15553 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MEFVO15553 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MEFVO15553 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MEFVO15553 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MEFVO15553 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MEFVO15553 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MEFVO15553 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MEFVO15553 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MEFVO15553 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MEFVO15553 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MEFVO15553 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MEFVO15553 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MEFVO15553 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MEFVO15553 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MEFVO15553 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MEFVO15553 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MEFVO15553 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MEFVO15553 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MEFVO15553 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MEFVO15553 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MEFVO15553 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MEFVO15553 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MEFVO15553 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MEFVO15553 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MEFVO15553 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MEFVO15553 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MEFVO15553 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MEFVO15553 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MEFVO15553 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.6 ms