Protein–RNA interactions for Protein: O15228

GNPAT, Dihydroxyacetone phosphate acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPATO15228 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GNPATO15228 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GNPATO15228 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GNPATO15228 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GNPATO15228 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GNPATO15228 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GNPATO15228 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GNPATO15228 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GNPATO15228 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GNPATO15228 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GNPATO15228 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GNPATO15228 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GNPATO15228 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GNPATO15228 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GNPATO15228 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GNPATO15228 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GNPATO15228 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GNPATO15228 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GNPATO15228 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GNPATO15228 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GNPATO15228 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GNPATO15228 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GNPATO15228 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GNPATO15228 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GNPATO15228 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GNPATO15228 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GNPATO15228 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GNPATO15228 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GNPATO15228 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GNPATO15228 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GNPATO15228 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GNPATO15228 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GNPATO15228 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GNPATO15228 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GNPATO15228 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GNPATO15228 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GNPATO15228 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GNPATO15228 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GNPATO15228 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GNPATO15228 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GNPATO15228 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GNPATO15228 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GNPATO15228 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GNPATO15228 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GNPATO15228 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GNPATO15228 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GNPATO15228 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GNPATO15228 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GNPATO15228 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GNPATO15228 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GNPATO15228 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GNPATO15228 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GNPATO15228 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GNPATO15228 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GNPATO15228 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GNPATO15228 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GNPATO15228 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GNPATO15228 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GNPATO15228 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GNPATO15228 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GNPATO15228 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GNPATO15228 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GNPATO15228 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GNPATO15228 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GNPATO15228 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
GNPATO15228 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GNPATO15228 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GNPATO15228 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
GNPATO15228 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GNPATO15228 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GNPATO15228 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GNPATO15228 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GNPATO15228 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GNPATO15228 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
GNPATO15228 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
GNPATO15228 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
GNPATO15228 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
GNPATO15228 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
GNPATO15228 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GNPATO15228 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GNPATO15228 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GNPATO15228 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GNPATO15228 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GNPATO15228 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GNPATO15228 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GNPATO15228 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GNPATO15228 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GNPATO15228 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GNPATO15228 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GNPATO15228 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GNPATO15228 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GNPATO15228 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GNPATO15228 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GNPATO15228 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GNPATO15228 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GNPATO15228 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GNPATO15228 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GNPATO15228 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
GNPATO15228 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GNPATO15228 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms