Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms