Protein–RNA interactions for Protein: O00505

KPNA3, Importin subunit alpha-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA3O00505 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KPNA3O00505 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KPNA3O00505 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KPNA3O00505 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KPNA3O00505 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KPNA3O00505 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KPNA3O00505 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KPNA3O00505 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KPNA3O00505 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KPNA3O00505 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KPNA3O00505 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KPNA3O00505 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KPNA3O00505 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KPNA3O00505 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KPNA3O00505 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
KPNA3O00505 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KPNA3O00505 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KPNA3O00505 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KPNA3O00505 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KPNA3O00505 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KPNA3O00505 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KPNA3O00505 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KPNA3O00505 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KPNA3O00505 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KPNA3O00505 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KPNA3O00505 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KPNA3O00505 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KPNA3O00505 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KPNA3O00505 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KPNA3O00505 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
KPNA3O00505 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KPNA3O00505 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
KPNA3O00505 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
KPNA3O00505 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KPNA3O00505 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KPNA3O00505 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KPNA3O00505 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KPNA3O00505 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KPNA3O00505 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KPNA3O00505 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KPNA3O00505 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KPNA3O00505 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KPNA3O00505 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KPNA3O00505 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KPNA3O00505 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KPNA3O00505 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KPNA3O00505 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KPNA3O00505 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
KPNA3O00505 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KPNA3O00505 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KPNA3O00505 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KPNA3O00505 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KPNA3O00505 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KPNA3O00505 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KPNA3O00505 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KPNA3O00505 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KPNA3O00505 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KPNA3O00505 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KPNA3O00505 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KPNA3O00505 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KPNA3O00505 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KPNA3O00505 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KPNA3O00505 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KPNA3O00505 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KPNA3O00505 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KPNA3O00505 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KPNA3O00505 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KPNA3O00505 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KPNA3O00505 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KPNA3O00505 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KPNA3O00505 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KPNA3O00505 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KPNA3O00505 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KPNA3O00505 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KPNA3O00505 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KPNA3O00505 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KPNA3O00505 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KPNA3O00505 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KPNA3O00505 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KPNA3O00505 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KPNA3O00505 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KPNA3O00505 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KPNA3O00505 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KPNA3O00505 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KPNA3O00505 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KPNA3O00505 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KPNA3O00505 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KPNA3O00505 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
KPNA3O00505 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KPNA3O00505 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KPNA3O00505 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
KPNA3O00505 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
KPNA3O00505 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KPNA3O00505 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KPNA3O00505 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KPNA3O00505 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KPNA3O00505 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KPNA3O00505 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KPNA3O00505 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KPNA3O00505 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms