Protein–RNA interactions for Protein: O00443

PIK3C2A, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2AO00443 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PIK3C2AO00443 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PIK3C2AO00443 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PIK3C2AO00443 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PIK3C2AO00443 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PIK3C2AO00443 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PIK3C2AO00443 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PIK3C2AO00443 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
PIK3C2AO00443 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PIK3C2AO00443 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PIK3C2AO00443 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PIK3C2AO00443 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PIK3C2AO00443 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PIK3C2AO00443 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PIK3C2AO00443 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PIK3C2AO00443 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PIK3C2AO00443 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PIK3C2AO00443 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PIK3C2AO00443 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PIK3C2AO00443 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PIK3C2AO00443 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PIK3C2AO00443 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PIK3C2AO00443 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PIK3C2AO00443 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PIK3C2AO00443 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PIK3C2AO00443 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PIK3C2AO00443 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PIK3C2AO00443 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PIK3C2AO00443 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PIK3C2AO00443 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PIK3C2AO00443 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PIK3C2AO00443 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PIK3C2AO00443 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PIK3C2AO00443 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PIK3C2AO00443 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PIK3C2AO00443 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PIK3C2AO00443 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PIK3C2AO00443 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PIK3C2AO00443 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PIK3C2AO00443 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PIK3C2AO00443 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PIK3C2AO00443 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PIK3C2AO00443 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PIK3C2AO00443 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PIK3C2AO00443 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PIK3C2AO00443 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PIK3C2AO00443 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PIK3C2AO00443 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PIK3C2AO00443 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PIK3C2AO00443 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PIK3C2AO00443 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PIK3C2AO00443 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PIK3C2AO00443 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PIK3C2AO00443 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PIK3C2AO00443 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PIK3C2AO00443 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PIK3C2AO00443 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PIK3C2AO00443 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PIK3C2AO00443 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PIK3C2AO00443 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PIK3C2AO00443 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PIK3C2AO00443 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PIK3C2AO00443 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PIK3C2AO00443 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PIK3C2AO00443 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PIK3C2AO00443 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PIK3C2AO00443 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PIK3C2AO00443 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PIK3C2AO00443 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PIK3C2AO00443 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PIK3C2AO00443 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PIK3C2AO00443 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PIK3C2AO00443 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PIK3C2AO00443 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PIK3C2AO00443 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PIK3C2AO00443 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PIK3C2AO00443 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
PIK3C2AO00443 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PIK3C2AO00443 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PIK3C2AO00443 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PIK3C2AO00443 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
PIK3C2AO00443 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PIK3C2AO00443 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
PIK3C2AO00443 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
PIK3C2AO00443 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PIK3C2AO00443 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PIK3C2AO00443 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
PIK3C2AO00443 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PIK3C2AO00443 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PIK3C2AO00443 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PIK3C2AO00443 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PIK3C2AO00443 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PIK3C2AO00443 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PIK3C2AO00443 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PIK3C2AO00443 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PIK3C2AO00443 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PIK3C2AO00443 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PIK3C2AO00443 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PIK3C2AO00443 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PIK3C2AO00443 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms