Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms