Protein–RNA interactions for Protein: A7E2F4

GOLGA8A, Golgin subfamily A member 8A, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8AA7E2F4 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLGA8AA7E2F4 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLGA8AA7E2F4 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLGA8AA7E2F4 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLGA8AA7E2F4 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLGA8AA7E2F4 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLGA8AA7E2F4 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLGA8AA7E2F4 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLGA8AA7E2F4 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLGA8AA7E2F4 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLGA8AA7E2F4 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLGA8AA7E2F4 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLGA8AA7E2F4 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLGA8AA7E2F4 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLGA8AA7E2F4 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLGA8AA7E2F4 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLGA8AA7E2F4 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLGA8AA7E2F4 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLGA8AA7E2F4 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLGA8AA7E2F4 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLGA8AA7E2F4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA8AA7E2F4 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA8AA7E2F4 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA8AA7E2F4 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA8AA7E2F4 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA8AA7E2F4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA8AA7E2F4 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA8AA7E2F4 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA8AA7E2F4 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA8AA7E2F4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA8AA7E2F4 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA8AA7E2F4 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA8AA7E2F4 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA8AA7E2F4 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA8AA7E2F4 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA8AA7E2F4 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA8AA7E2F4 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA8AA7E2F4 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA8AA7E2F4 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA8AA7E2F4 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA8AA7E2F4 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA8AA7E2F4 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA8AA7E2F4 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA8AA7E2F4 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA8AA7E2F4 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA8AA7E2F4 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA8AA7E2F4 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA8AA7E2F4 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA8AA7E2F4 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA8AA7E2F4 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA8AA7E2F4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA8AA7E2F4 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA8AA7E2F4 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA8AA7E2F4 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA8AA7E2F4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA8AA7E2F4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA8AA7E2F4 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA8AA7E2F4 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA8AA7E2F4 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA8AA7E2F4 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA8AA7E2F4 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA8AA7E2F4 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA8AA7E2F4 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA8AA7E2F4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA8AA7E2F4 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA8AA7E2F4 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA8AA7E2F4 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA8AA7E2F4 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA8AA7E2F4 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA8AA7E2F4 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA8AA7E2F4 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA8AA7E2F4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA8AA7E2F4 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA8AA7E2F4 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA8AA7E2F4 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA8AA7E2F4 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA8AA7E2F4 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA8AA7E2F4 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA8AA7E2F4 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA8AA7E2F4 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA8AA7E2F4 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA8AA7E2F4 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA8AA7E2F4 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA8AA7E2F4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA8AA7E2F4 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA8AA7E2F4 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA8AA7E2F4 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA8AA7E2F4 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA8AA7E2F4 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA8AA7E2F4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA8AA7E2F4 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA8AA7E2F4 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA8AA7E2F4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA8AA7E2F4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA8AA7E2F4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA8AA7E2F4 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA8AA7E2F4 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA8AA7E2F4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA8AA7E2F4 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA8AA7E2F4 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms