Protein–RNA interactions for Protein: A6NNY8

USP27X, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP27XA6NNY8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
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