Protein–RNA interactions for Protein: A6NK58

LIPT2, Putative lipoyltransferase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPT2A6NK58 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms