Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP17L4A6NCW7 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP17L4A6NCW7 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
USP17L4A6NCW7 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
USP17L4A6NCW7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP17L4A6NCW7 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP17L4A6NCW7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP17L4A6NCW7 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP17L4A6NCW7 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP17L4A6NCW7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP17L4A6NCW7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP17L4A6NCW7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP17L4A6NCW7 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP17L4A6NCW7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP17L4A6NCW7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP17L4A6NCW7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP17L4A6NCW7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP17L4A6NCW7 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP17L4A6NCW7 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP17L4A6NCW7 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
USP17L4A6NCW7 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
USP17L4A6NCW7 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
USP17L4A6NCW7 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
USP17L4A6NCW7 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP17L4A6NCW7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms