Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms