Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQF3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQF3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
A0A0U1RQF3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
A0A0U1RQF3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.04
A0A0U1RQF3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
A0A0U1RQF3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
A0A0U1RQF3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
A0A0U1RQF3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
A0A0U1RQF3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
A0A0U1RQF3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
A0A0U1RQF3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
A0A0U1RQF3 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
A0A0U1RQF3 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
A0A0U1RQF3 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
A0A0U1RQF3 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
A0A0U1RQF3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
A0A0U1RQF3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
A0A0U1RQF3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
A0A0U1RQF3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
A0A0U1RQF3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
A0A0U1RQF3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
A0A0U1RQF3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
A0A0U1RQF3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
A0A0U1RQF3 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
A0A0U1RQF3 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
A0A0U1RQF3 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
A0A0U1RQF3 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
A0A0U1RQF3 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
A0A0U1RQF3 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
A0A0U1RQF3 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
A0A0U1RQF3 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
A0A0U1RQF3 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
A0A0U1RQF3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
A0A0U1RQF3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
A0A0U1RQF3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
A0A0U1RQF3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
A0A0U1RQF3 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
A0A0U1RQF3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
A0A0U1RQF3 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
A0A0U1RQF3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
A0A0U1RQF3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
A0A0U1RQF3 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
A0A0U1RQF3 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
A0A0U1RQF3 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
A0A0U1RQF3 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
A0A0U1RQF3 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
A0A0U1RQF3 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
A0A0U1RQF3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
A0A0U1RQF3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
A0A0U1RQF3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
A0A0U1RQF3 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
A0A0U1RQF3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
A0A0U1RQF3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
A0A0U1RQF3 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
A0A0U1RQF3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
A0A0U1RQF3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
A0A0U1RQF3 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
A0A0U1RQF3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
A0A0U1RQF3 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
A0A0U1RQF3 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
A0A0U1RQF3 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
A0A0U1RQF3 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
A0A0U1RQF3 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
A0A0U1RQF3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
A0A0U1RQF3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
A0A0U1RQF3 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
A0A0U1RQF3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
A0A0U1RQF3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
A0A0U1RQF3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
A0A0U1RQF3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
A0A0U1RQF3 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
A0A0U1RQF3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
A0A0U1RQF3 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
A0A0U1RQF3 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
A0A0U1RQF3 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
A0A0U1RQF3 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
A0A0U1RQF3 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
A0A0U1RQF3 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
A0A0U1RQF3 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
A0A0U1RQF3 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
A0A0U1RQF3 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
A0A0U1RQF3 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
A0A0U1RQF3 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
A0A0U1RQF3 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
A0A0U1RQF3 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
A0A0U1RQF3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
A0A0U1RQF3 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
A0A0U1RQF3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
A0A0U1RQF3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
A0A0U1RQF3 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
A0A0U1RQF3 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms