Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AC011462.3-201ENST00000598988 540 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AC108451.2-201ENST00000603875 538 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AC023513.1-201ENST00000604396 691 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 Metazoa_SRP.189-201ENST00000614219 303 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 SLC14A1-221ENST00000619403 3823 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 PDAP1-205ENST00000626285 120 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AL009031.1-201ENST00000632346 1026 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 LUC7L2-201ENST00000263545 2287 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AC015871.3-201ENST00000618835 2261 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 DOCK4-216ENST00000494651 3282 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 FGF10-201ENST00000264664 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 ZNF812P-201ENST00000457674 1694 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 MAPK10-251ENST00000640858 3052 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 BEST3-202ENST00000330891 3532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AC241584.2-201ENST00000637142 2090 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 TXNIP-204ENST00000582401 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 MBNL2-202ENST00000345429 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 NXF2B-204ENST00000618302 2884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 CASP10-203ENST00000313728 1521 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 AL157713.1-201ENST00000379752 1531 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 MMACHC-203ENST00000616135 1510 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 AL137918.1-201ENST00000624542 1922 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 LARP1B-201ENST00000326639 4891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 SEC23IP-208ENST00000543134 1461 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 PRRC1-204ENST00000512635 2726 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 LRP2BP-203ENST00000510776 3055 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 RPGRIP1L-206ENST00000564374 3877 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 TFDP2-222ENST00000495310 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 FBXO3-209ENST00000531080 1448 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 NAALAD2-201ENST00000321955 3035 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 LRRC37B-203ENST00000394713 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 OR4F17-203ENST00000618231 2586 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 MED21-201ENST00000282892 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 ENO1P4-201ENST00000416471 1785 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 TCP11X2-202ENST00000453326 1747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 TCP11X1-201ENST00000597070 1747 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 NPM1-204ENST00000517671 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 AC092821.3-202ENST00000641304 2767 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 C1orf54-203ENST00000369102 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 TRMT13-203ENST00000370143 476 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 MIR199B-201ENST00000384849 110 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 TRAV5-201ENST00000390427 352 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 CES5AP1-201ENST00000400418 859 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 PPP1R17-202ENST00000409146 569 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 AC007091.1-201ENST00000412563 566 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 TPRG1-AS2-201ENST00000425454 479 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 OR5G3-201ENST00000435756 929 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 LINC00652-202ENST00000454749 963 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 AC016489.1-201ENST00000461109 375 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 AC117395.2-201ENST00000463122 1128 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
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RTL8BQ17RB0 LINC02059-201ENST00000503843 452 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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RTL8BQ17RB0 LINC00906-202ENST00000587998 648 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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RTL8BQ17RB0 PRPS1L1-202ENST00000638645 957 ntAPPRIS P2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 CCRL2-201ENST00000357392 1593 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
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RTL8BQ17RB0 FAM135A-207ENST00000457062 5282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 AC025263.1-201ENST00000501387 2538 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 AL162171.3-201ENST00000617439 3178 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 CTNNA1-244ENST00000627109 3831 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 TLR10-204ENST00000506111 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 ZNF562-202ENST00000453372 2111 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 LARS-212ENST00000510191 3737 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 EPHA3-203ENST00000494014 3085 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 MMP10-201ENST00000279441 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 AC008560.1-201ENST00000510585 1766 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 FGA-201ENST00000302053 3678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 TRIM34-201ENST00000429814 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 KCNJ1-205ENST00000392666 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 AL357153.1-201ENST00000500016 2941 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 CD163-202ENST00000396620 3800 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 TMEM200A-202ENST00000392429 5017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 VTCN1-201ENST00000328189 2289 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 STN1-202ENST00000369764 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 DMD-228ENST00000541735 7080 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 KCNMB2-202ENST00000420517 1563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
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