Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI63

KRTAP20-1, Keratin-associated protein 20-1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-1Q3LI63 AL121612.2-201ENST00000612261 482 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 uc_338.21-201ENST00000622458 147 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 AC061999.1-201ENST00000624454 177 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 AC024023.1-201ENST00000624530 922 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 UQCRC2-213ENST00000630839 535 ntTSL 4 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 AC107068.2-201ENST00000634611 447 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 CCDC66-203ENST00000394672 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 ELP4-210ENST00000638482 3084 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 CNGA2-201ENST00000329903 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 MID1-203ENST00000380780 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 FBXO8-201ENST00000393674 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 AL441943.2-201ENST00000421077 2321 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 TEX41-210ENST00000451774 2098 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 CLTC-215ENST00000621829 8587 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 ERAP2-202ENST00000437043 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 CTH-202ENST00000370938 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 RTN4-206ENST00000394611 4161 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 SRFBP1-201ENST00000339397 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 LINC01015-203ENST00000434657 2874 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 FTO-222ENST00000637969 2889 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 GNA12-203ENST00000407904 3918 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 PSPN-202ENST00000597721 3911 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF763-201ENST00000343949 2621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 TRPM3-214ENST00000396292 4740 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 MAT1A-201ENST00000372213 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF778-201ENST00000306502 2386 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF160-202ENST00000418871 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 PSMB2-202ENST00000621781 4217 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 CHMP3-201ENST00000263856 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 PLEKHM1P1-204ENST00000582201 3166 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 ITSN2-202ENST00000361999 5814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 POGZ-201ENST00000271715 6626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 TLR10-202ENST00000361424 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 ACSBG2-210ENST00000591403 2690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 SPATA2-201ENST00000289431 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 PBRM1-203ENST00000356770 7523 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 C18orf32-203ENST00000613385 5395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 ACAP2-215ENST00000618471 3207 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 OR2M4-202ENST00000641868 5934 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 AL139805.2-201ENST00000455305 2433 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 LRRTM4-205ENST00000409911 2976 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 TRPV1-203ENST00000399759 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 PPWD1-201ENST00000261308 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 PHKB-208ENST00000566044 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 SNRPD1-201ENST00000300413 4909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF259P1-202ENST00000572422 4912 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 DISP2-201ENST00000267889 12614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 ZMYND11-207ENST00000397959 4138 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 ACSBG2-206ENST00000588485 2478 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 NEK1-207ENST00000511633 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 STAU1-201ENST00000340954 3334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 CX3CL1-201ENST00000006053 3321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 HFE-207ENST00000357618 5286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 TRPM3-213ENST00000396285 4701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 STMN2-201ENST00000220876 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 CREM-204ENST00000345491 2220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 NCF2-202ENST00000367536 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 C15orf41-202ENST00000437989 2240 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 CHEK1-204ENST00000438015 4153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 FP565260.7-201ENST00000623998 3634 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 FCRLA-209ENST00000367957 1684 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 ZRANB2-202ENST00000370920 3078 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 PEX13-201ENST00000295030 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 DDHD1-210ENST00000612692 12339 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 NAIP-204ENST00000503719 5347 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 JAM3-201ENST00000299106 3912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 RPAP1-202ENST00000561603 3906 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 AC023154.1-201ENST00000510351 2517 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF589-201ENST00000354698 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 VPS11-206ENST00000614944 3388 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 AL162274.3-201ENST00000623138 3109 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 CLEC5A-207ENST00000551012 1420 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 KLHL20-201ENST00000209884 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 EZH2-203ENST00000460911 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 ADGRG1-255ENST00000567835 3741 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 GPX6-201ENST00000361902 1712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 ZBED8-201ENST00000408953 2851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 AL353616.1-201ENST00000436315 2860 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 AF131215.2-201ENST00000531549 1710 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 NTN4-202ENST00000344911 3152 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 PLK4-203ENST00000507249 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 STXBP5-AS1-209ENST00000606831 2025 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 EPS15L1-212ENST00000597937 3486 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 TNFSF15-202ENST00000374045 6687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 TIAM2-208ENST00000461783 6981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 EIF1-203ENST00000469257 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 FRYL-210ENST00000507711 5277 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 SIRPB1-205ENST00000381605 3241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 RAPGEF5-202ENST00000401957 6159 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 TBX5-201ENST00000310346 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 PTK2B-201ENST00000346049 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 AL008638.2-201ENST00000453934 2383 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 SH3D19-204ENST00000427414 2656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 CCR6-202ENST00000349984 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 KPNB1-203ENST00000540627 2989 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 RHBDF2-215ENST00000591885 3599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.7 ms