Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 NBPF14-201ENST00000581201 2931 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 NBPF26-206ENST00000617913 2931 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AL589993.1-201ENST00000407450 2524 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 LINC00310-204ENST00000430922 2086 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AC090771.1-201ENST00000585803 1618 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 FOXJ3-204ENST00000372572 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AL033543.1-201ENST00000623440 13454 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 GALNTL5-206ENST00000431418 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 DTNA-206ENST00000399121 6490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 INTS7-204ENST00000440600 3136 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 SYT4-201ENST00000255224 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 GABRA1-211ENST00000635880 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 GRIA3-204ENST00000541091 2740 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 LINC01197-205ENST00000614853 1774 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AL353898.3-201ENST00000624679 1755 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AHSP-201ENST00000302312 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 OR52N5-201ENST00000317093 1034 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 U3.1-201ENST00000362500 215 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 GPX2-201ENST00000389614 990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 IGLJ2-201ENST00000390322 175 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AC113608.1-201ENST00000398740 305 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 LSM5-202ENST00000409292 538 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AL024497.1-201ENST00000412954 631 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 PPIAP30-201ENST00000415473 519 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 FTOP1-201ENST00000419363 861 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AC114752.2-201ENST00000424119 404 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AL121917.1-202ENST00000424434 367 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 RPSAP62-201ENST00000432596 833 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AC106869.1-202ENST00000441997 604 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 LINC00578-202ENST00000442937 612 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 RPSA-202ENST00000443003 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AC011742.2-201ENST00000443818 352 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AC092164.1-203ENST00000444501 723 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 GTF2F2P2-201ENST00000445825 721 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 CDC42P2-201ENST00000448566 569 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AC023590.1-203ENST00000449065 411 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 EAF2-202ENST00000451944 960 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 LINC01320-202ENST00000453774 1205 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AC009269.1-201ENST00000470368 833 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 B4GALT4-209ENST00000471675 712 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 RN7SL705P-201ENST00000481678 294 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AC097263.1-201ENST00000496795 606 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 SMIM20-202ENST00000514384 774 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 LINC01288-201ENST00000519189 529 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 RGS5-220ENST00000528689 566 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 RAP1B-230ENST00000543697 734 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 GOLGA6L5P-203ENST00000559768 578 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AC068831.6-201ENST00000560522 795 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AC099508.2-201ENST00000563098 510 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AC133569.1-201ENST00000564327 373 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AP005328.1-201ENST00000577719 681 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 LINC01919-203ENST00000581198 598 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AC005495.1-201ENST00000586611 1211 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 SNRPCP20-201ENST00000588011 210 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AC011509.2-201ENST00000592263 627 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AP003481.1-202ENST00000608214 503 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 CT45A8-202ENST00000611660 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 CT45A10-201ENST00000611668 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 CT45A2-202ENST00000612907 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 CCL4L2-212ENST00000615418 954 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 CT45A9-202ENST00000620704 1010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 C18orf12-201ENST00000623329 537 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AL049536.1-202ENST00000623572 455 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 KCNJ10-204ENST00000637644 1239 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AP001636.3-201ENST00000533954 2810 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 LINC00907-205ENST00000589068 1812 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 TLR4-202ENST00000394487 3908 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 PDE4D-226ENST00000546160 7690 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 GPR33-201ENST00000399285 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 TRPM7-201ENST00000313478 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 NEDD9-216ENST00000620854 4086 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 CARD8-217ENST00000520753 3041 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 LINC02044-201ENST00000490139 2502 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AC007066.2-201ENST00000561961 1993 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AC087430.1-201ENST00000451707 3699 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AL031651.1-201ENST00000615357 1438 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 MRPS31-201ENST00000323563 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AC061975.7-201ENST00000592016 2692 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 EPHA6-204ENST00000502694 1582 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 ZNF268-201ENST00000228289 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 ARNT-201ENST00000354396 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 TCF4-284ENST00000637169 7553 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AC139491.2-201ENST00000515403 3632 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 N4BP2-201ENST00000261435 9744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 HCG18-239ENST00000454129 4433 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 PSG1-203ENST00000403380 1722 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 PCDH18-201ENST00000344876 5906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 ERVFRD-1-201ENST00000472091 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AC090673.1-202ENST00000356215 4617 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 CLCN3-202ENST00000360642 3208 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 LRRC31-202ENST00000316428 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 PRND-201ENST00000305817 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 DTNA-207ENST00000444659 6343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 ARMCX5-202ENST00000372742 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 ZNF816-203ENST00000357666 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 CD300E-201ENST00000392619 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 CDY2A-201ENST00000250838 1954 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 CLEC3A-201ENST00000299642 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 PHF5A-201ENST00000216252 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 PSORS1C1-201ENST00000259881 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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