Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 IGLV1-62-201ENST00000518003 441 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SPTBN1Q01082 IGHV3-75-201ENST00000523951 358 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SPTBN1Q01082 AC108471.2-205ENST00000529314 628 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SPTBN1Q01082 AC007614.3-201ENST00000564875 654 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SPTBN1Q01082 AC104581.3-201ENST00000573621 348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SPTBN1Q01082 AC239803.2-201ENST00000610161 430 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SPTBN1Q01082 CCL15-204ENST00000617897 1073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
SPTBN1Q01082 AC092574.2-201ENST00000631198 753 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SPTBN1Q01082 SEC62-201ENST00000337002 6568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
SPTBN1Q01082 SYTL4-203ENST00000372981 4847 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SPTBN1Q01082 PARP9-205ENST00000477522 3128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
SPTBN1Q01082 TEX14-201ENST00000240361 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
SPTBN1Q01082 GJB7-203ENST00000525899 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
SPTBN1Q01082 CTNND1-234ENST00000532844 6012 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
SPTBN1Q01082 PSG8-203ENST00000404209 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
SPTBN1Q01082 TSNAX-201ENST00000366639 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
SPTBN1Q01082 INTS2-201ENST00000251334 4255 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SPTBN1Q01082 ZMYND8-221ENST00000619049 4027 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SPTBN1Q01082 AC068733.1-202ENST00000531479 2456 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SPTBN1Q01082 FAM13A-218ENST00000511976 3579 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SPTBN1Q01082 IL18RAP-202ENST00000409369 1890 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SPTBN1Q01082 AL391988.1-201ENST00000614747 1553 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SPTBN1Q01082 AC242022.1-201ENST00000638002 1565 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SPTBN1Q01082 ST18-201ENST00000276480 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SPTBN1Q01082 OR2T33-202ENST00000641220 4118 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SPTBN1Q01082 C11orf88-203ENST00000529167 3099 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SPTBN1Q01082 RERGL-201ENST00000229002 1147 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SPTBN1Q01082 CNTRL-202ENST00000373844 713 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SPTBN1Q01082 RNA5SP431-201ENST00000410312 120 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SPTBN1Q01082 AC011752.1-203ENST00000417609 582 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SPTBN1Q01082 CDC42P6-201ENST00000421246 576 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SPTBN1Q01082 LINC01771-201ENST00000445039 567 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SPTBN1Q01082 AC078785.2-201ENST00000462010 1253 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SPTBN1Q01082 PFN2-213ENST00000494827 793 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SPTBN1Q01082 RN7SL775P-201ENST00000498361 336 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SPTBN1Q01082 SCARNA20.1-201ENST00000516009 138 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SPTBN1Q01082 IGKV3-34-201ENST00000521692 293 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SPTBN1Q01082 AC090193.1-202ENST00000524355 566 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SPTBN1Q01082 AC084851.2-201ENST00000530377 364 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SPTBN1Q01082 ACER3-213ENST00000533873 929 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SPTBN1Q01082 AL049844.1-201ENST00000545614 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SPTBN1Q01082 COPZ1-205ENST00000548753 778 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SPTBN1Q01082 ZNF730-201ENST00000593635 464 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SPTBN1Q01082 AC089999.3-201ENST00000622440 577 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SPTBN1Q01082 SV2B-202ENST00000394232 11279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SPTBN1Q01082 TLR1-202ENST00000502213 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SPTBN1Q01082 EEF1A1P12-201ENST00000443590 1346 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SPTBN1Q01082 ALKBH8-202ENST00000389568 2491 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SPTBN1Q01082 AC016831.3-201ENST00000446451 1723 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SPTBN1Q01082 C9orf72-206ENST00000619707 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SPTBN1Q01082 LNX1-201ENST00000263925 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SPTBN1Q01082 HNRNPU-223ENST00000640001 4227 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SPTBN1Q01082 STAU1-210ENST00000614381 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SPTBN1Q01082 CSF2RA-205ENST00000381524 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SPTBN1Q01082 NME8-201ENST00000199447 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SPTBN1Q01082 FAM107A-201ENST00000360997 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SPTBN1Q01082 SLC25A24-202ENST00000370041 3404 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SPTBN1Q01082 GDPD4-201ENST00000315938 2533 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SPTBN1Q01082 SLC14A1-201ENST00000321925 3971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SPTBN1Q01082 NRXN3-207ENST00000554719 4156 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SPTBN1Q01082 SCAPER-202ENST00000324767 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SPTBN1Q01082 PRDX6-201ENST00000340385 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SPTBN1Q01082 RNA5SP308-201ENST00000362532 115 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SPTBN1Q01082 RNA5SP114-201ENST00000363780 113 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SPTBN1Q01082 AL512422.1-201ENST00000407033 553 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SPTBN1Q01082 LINC01066-201ENST00000415283 399 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SPTBN1Q01082 AC092042.2-201ENST00000417304 331 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SPTBN1Q01082 EEF1GP7-201ENST00000422983 703 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SPTBN1Q01082 AL139158.1-201ENST00000424719 340 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SPTBN1Q01082 FUNDC2P2-202ENST00000443452 493 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SPTBN1Q01082 AC093816.1-201ENST00000515076 913 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SPTBN1Q01082 SERPINA15P-201ENST00000529287 266 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SPTBN1Q01082 AC024257.1-201ENST00000547523 566 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SPTBN1Q01082 SLC7A7-210ENST00000554517 1158 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SPTBN1Q01082 AL031846.1-201ENST00000560933 314 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SPTBN1Q01082 ZNF174-204ENST00000572544 1002 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SPTBN1Q01082 LINC00469-203ENST00000579749 583 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SPTBN1Q01082 FAM13A-AS1_2.1-201ENST00000611121 108 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SPTBN1Q01082 MIR6849-201ENST00000618543 69 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SPTBN1Q01082 AC008626.2-201ENST00000624425 248 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SPTBN1Q01082 AC119674.1-221ENST00000641594 1213 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SPTBN1Q01082 CDH18-201ENST00000274170 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SPTBN1Q01082 MEF2C-232ENST00000629612 2851 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SPTBN1Q01082 FASLG-202ENST00000367721 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SPTBN1Q01082 LINC02179-201ENST00000561523 3673 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SPTBN1Q01082 DZANK1-203ENST00000357236 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SPTBN1Q01082 EPB41-202ENST00000347529 2676 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SPTBN1Q01082 ABCD3-202ENST00000370214 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
SPTBN1Q01082 MAP3K13-209ENST00000443863 3025 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SPTBN1Q01082 LINC02312-201ENST00000555187 3046 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SPTBN1Q01082 ZNFX1-202ENST00000371752 7212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SPTBN1Q01082 NEDD9-202ENST00000379446 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
SPTBN1Q01082 HRH1-201ENST00000397056 4711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
SPTBN1Q01082 KCNMA1-212ENST00000406533 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SPTBN1Q01082 COL24A1-201ENST00000370571 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
SPTBN1Q01082 ALMS1-207ENST00000614410 11700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SPTBN1Q01082 LNX1-202ENST00000306888 3757 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
SPTBN1Q01082 LINC00954-202ENST00000449086 2995 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
SPTBN1Q01082 FCGR3B-202ENST00000367964 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SPTBN1Q01082 FIG4-202ENST00000368941 791 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms