Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 OR52K3P-201ENST00000531655 943 ntBASIC9□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 RPL27A-210ENST00000531978 867 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 SETP17-201ENST00000534163 817 ntBASIC9□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 C14orf119-202ENST00000554203 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 AC005726.4-201ENST00000582858 458 ntBASIC9□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 LINC02028-206ENST00000593326 810 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 MIR6861-201ENST00000618657 64 ntBASIC9□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 AC017037.4-201ENST00000624526 826 ntBASIC9□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 ATXN2-202ENST00000389153 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 KIAA0391-203ENST00000534898 2611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 PTPN3-201ENST00000262539 6832 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 TRIO-214ENST00000509967 4949 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 ZNF611-204ENST00000543227 4517 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 DIS3L2-202ENST00000325385 3501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 UBR1-202ENST00000546274 3332 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 TEFM-204ENST00000580840 2109 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 MAPK10-357ENST00000641831 2858 ntBASIC9□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 PCDH15-229ENST00000616114 5846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 FASLG-202ENST00000367721 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 CLCN5-201ENST00000307367 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 FBXL20-201ENST00000264658 10388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 CEACAM5-203ENST00000405816 2354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 AC087501.5-201ENST00000607496 2374 ntBASIC9□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 IL5RA-203ENST00000383846 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 FAM204BP-201ENST00000369171 701 ntBASIC9□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 BCL11A-205ENST00000409351 756 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 AL590128.1-201ENST00000433407 286 ntBASIC9□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 RN7SL797P-201ENST00000486314 297 ntBASIC9□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 AC021146.11-201ENST00000503319 491 ntBASIC9□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 PGAM4P2-201ENST00000512491 721 ntBASIC9□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 RN7SKP196-201ENST00000516267 345 ntBASIC9□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 AC026826.3-201ENST00000561747 158 ntBASIC9□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 AC068802.1-201ENST00000603420 732 ntBASIC9□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 LINC02535-201ENST00000455071 2513 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 MAP4K4-203ENST00000347699 3792 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 AC008676.2-202ENST00000509655 1992 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 AC116535.1-201ENST00000499765 2335 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 LINC02418-202ENST00000567788 4592 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 DICER1-204ENST00000527414 6179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 ANKRD42-202ENST00000393389 4066 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 USP6-205ENST00000574788 8464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 TMX2-202ENST00000378312 1521 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 PRICKLE2-205ENST00000638394 9956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 KCNK2-203ENST00000444842 3379 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 RAI14-205ENST00000503673 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 AP2B1-213ENST00000612116 3483 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 PAH-201ENST00000307000 2466 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 CYP4F30P-203ENST00000438109 2250 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 LY75-CD302-201ENST00000504764 5650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 CRNKL1-201ENST00000377327 4370 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 MTPN-201ENST00000393085 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 CD46-209ENST00000367047 3089 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 LGI1-211ENST00000630047 1751 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 SIRPB1-205ENST00000381605 3241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 CCL2-201ENST00000225831 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 GMFG-201ENST00000253054 616 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 ATP5J-206ENST00000400099 492 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 RNA5SP115-201ENST00000411160 107 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 AL773545.3-201ENST00000414297 706 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 UQCRHP1-204ENST00000424609 274 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 AC010148.1-201ENST00000427619 707 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 MIR181A2HG-201ENST00000429139 662 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 AC018804.1-201ENST00000430381 618 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 HMGN1P2-201ENST00000445197 310 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 AC067817.2-201ENST00000459965 387 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 AL138787.2-201ENST00000466576 367 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 KCNU1-202ENST00000518904 334 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 AZIN1-AS1-211ENST00000520455 480 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 COPZ1-205ENST00000548753 778 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 SIGLECL1-205ENST00000597824 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 AC020914.2-201ENST00000598220 430 ntTSL 4 BASIC8.99□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 Metazoa_SRP.70-201ENST00000612622 273 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 CASC19-208ENST00000641056 1292 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 CASC19-227ENST00000641411 1285 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 SH2D1B-201ENST00000367929 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 ARHGEF11-202ENST00000368194 6889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 KIAA1671-202ENST00000401395 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 ZCCHC11-204ENST00000371544 5858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 SPATA13-201ENST00000343003 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 DUXAP8-204ENST00000447898 4136 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 OR1D2-203ENST00000641833 4887 ntAPPRIS P1 BASIC8.99□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 AL590705.5-202ENST00000375204 3161 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 VEPH1-201ENST00000362010 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 SLC5A1-201ENST00000266088 5061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 KCNS3-202ENST00000403915 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 CNPY1-204ENST00000636446 1637 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 SEC23IP-208ENST00000543134 1461 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 TAF12-202ENST00000373824 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 ZNF626-203ENST00000601440 5963 ntTSL 4 BASIC8.98□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 HPS4-201ENST00000336873 3786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 ST6GAL2-201ENST00000361686 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 RBM46-201ENST00000281722 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 MAPK14-203ENST00000310795 1066 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 XAGE3-201ENST00000346279 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 GEMIN2P2-201ENST00000418195 715 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 VN1R3-201ENST00000418822 919 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 OR6R1P-201ENST00000431838 940 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 MAJIN-202ENST00000432175 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 OR7A15P-201ENST00000449848 1009 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 AC007099.1-201ENST00000451622 1185 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 349.3 ms