Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

BIVM-ERCC5, BIVM-ERCC5 readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC33.61■■■□□ 2.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC33.61■■■□□ 2.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC33.59■■■□□ 2.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC33.57■■■□□ 2.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms