Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC4A4Q9Y6R1 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC4A4Q9Y6R1 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC4A4Q9Y6R1 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC4A4Q9Y6R1 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC4A4Q9Y6R1 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC4A4Q9Y6R1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC4A4Q9Y6R1 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC4A4Q9Y6R1 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC4A4Q9Y6R1 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC4A4Q9Y6R1 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC4A4Q9Y6R1 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC4A4Q9Y6R1 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC4A4Q9Y6R1 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC4A4Q9Y6R1 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC4A4Q9Y6R1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC4A4Q9Y6R1 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC4A4Q9Y6R1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC4A4Q9Y6R1 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC4A4Q9Y6R1 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC4A4Q9Y6R1 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC4A4Q9Y6R1 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC4A4Q9Y6R1 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC4A4Q9Y6R1 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC4A4Q9Y6R1 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC4A4Q9Y6R1 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC4A4Q9Y6R1 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC4A4Q9Y6R1 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC4A4Q9Y6R1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC4A4Q9Y6R1 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC4A4Q9Y6R1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC4A4Q9Y6R1 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC4A4Q9Y6R1 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC4A4Q9Y6R1 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC4A4Q9Y6R1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC4A4Q9Y6R1 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC4A4Q9Y6R1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC4A4Q9Y6R1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC4A4Q9Y6R1 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC4A4Q9Y6R1 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC4A4Q9Y6R1 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC4A4Q9Y6R1 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC4A4Q9Y6R1 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC4A4Q9Y6R1 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC4A4Q9Y6R1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC4A4Q9Y6R1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC4A4Q9Y6R1 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC4A4Q9Y6R1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC4A4Q9Y6R1 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC4A4Q9Y6R1 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC4A4Q9Y6R1 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC4A4Q9Y6R1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC4A4Q9Y6R1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC4A4Q9Y6R1 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC4A4Q9Y6R1 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC4A4Q9Y6R1 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC4A4Q9Y6R1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC4A4Q9Y6R1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC4A4Q9Y6R1 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC4A4Q9Y6R1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC4A4Q9Y6R1 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC4A4Q9Y6R1 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC4A4Q9Y6R1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC4A4Q9Y6R1 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC4A4Q9Y6R1 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC4A4Q9Y6R1 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC4A4Q9Y6R1 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC4A4Q9Y6R1 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC4A4Q9Y6R1 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC4A4Q9Y6R1 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC4A4Q9Y6R1 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC4A4Q9Y6R1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC4A4Q9Y6R1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC4A4Q9Y6R1 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC4A4Q9Y6R1 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC4A4Q9Y6R1 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC4A4Q9Y6R1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC4A4Q9Y6R1 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC4A4Q9Y6R1 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC4A4Q9Y6R1 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC4A4Q9Y6R1 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC4A4Q9Y6R1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC4A4Q9Y6R1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC4A4Q9Y6R1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC4A4Q9Y6R1 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC4A4Q9Y6R1 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC4A4Q9Y6R1 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC4A4Q9Y6R1 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC4A4Q9Y6R1 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC4A4Q9Y6R1 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms