Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X1

SNX9, Sorting nexin-9, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX9Q9Y5X1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms