Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y446

PKP3, Plakophilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3Q9Y446 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PKP3Q9Y446 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PKP3Q9Y446 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PKP3Q9Y446 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PKP3Q9Y446 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PKP3Q9Y446 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PKP3Q9Y446 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PKP3Q9Y446 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PKP3Q9Y446 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
PKP3Q9Y446 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PKP3Q9Y446 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PKP3Q9Y446 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PKP3Q9Y446 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PKP3Q9Y446 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKP3Q9Y446 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKP3Q9Y446 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKP3Q9Y446 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKP3Q9Y446 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKP3Q9Y446 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKP3Q9Y446 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKP3Q9Y446 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKP3Q9Y446 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKP3Q9Y446 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKP3Q9Y446 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKP3Q9Y446 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKP3Q9Y446 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PKP3Q9Y446 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKP3Q9Y446 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKP3Q9Y446 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKP3Q9Y446 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PKP3Q9Y446 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKP3Q9Y446 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKP3Q9Y446 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKP3Q9Y446 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKP3Q9Y446 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKP3Q9Y446 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKP3Q9Y446 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PKP3Q9Y446 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PKP3Q9Y446 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PKP3Q9Y446 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PKP3Q9Y446 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PKP3Q9Y446 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PKP3Q9Y446 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PKP3Q9Y446 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PKP3Q9Y446 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PKP3Q9Y446 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PKP3Q9Y446 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PKP3Q9Y446 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PKP3Q9Y446 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PKP3Q9Y446 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PKP3Q9Y446 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PKP3Q9Y446 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PKP3Q9Y446 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms