Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
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SH3BP1Q9Y3L3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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SH3BP1Q9Y3L3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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