Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2N7

HIF3A, Hypoxia-inducible factor 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF3AQ9Y2N7 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms