Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D1

ATF5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF5Q9Y2D1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 CAMTA1-205ENST00000467404 546 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 Metazoa_SRP.67-201ENST00000617099 296 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATF5Q9Y2D1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATF5Q9Y2D1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATF5Q9Y2D1 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATF5Q9Y2D1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms