Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y251

HPSE, Heparanase, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPSEQ9Y251 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms