Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y241

HIGD1A, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1AQ9Y241 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms