Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVW-1Q9UQF0 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms