Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRAK1Q9UPV9 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRAK1Q9UPV9 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRAK1Q9UPV9 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
TRAK1Q9UPV9 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRAK1Q9UPV9 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRAK1Q9UPV9 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRAK1Q9UPV9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
TRAK1Q9UPV9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TRAK1Q9UPV9 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
TRAK1Q9UPV9 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRAK1Q9UPV9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRAK1Q9UPV9 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRAK1Q9UPV9 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRAK1Q9UPV9 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
TRAK1Q9UPV9 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRAK1Q9UPV9 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRAK1Q9UPV9 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRAK1Q9UPV9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRAK1Q9UPV9 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRAK1Q9UPV9 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRAK1Q9UPV9 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRAK1Q9UPV9 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRAK1Q9UPV9 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRAK1Q9UPV9 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
TRAK1Q9UPV9 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRAK1Q9UPV9 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRAK1Q9UPV9 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRAK1Q9UPV9 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRAK1Q9UPV9 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRAK1Q9UPV9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRAK1Q9UPV9 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRAK1Q9UPV9 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRAK1Q9UPV9 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRAK1Q9UPV9 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRAK1Q9UPV9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRAK1Q9UPV9 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TRAK1Q9UPV9 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRAK1Q9UPV9 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRAK1Q9UPV9 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TRAK1Q9UPV9 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRAK1Q9UPV9 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRAK1Q9UPV9 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRAK1Q9UPV9 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRAK1Q9UPV9 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TRAK1Q9UPV9 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRAK1Q9UPV9 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRAK1Q9UPV9 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRAK1Q9UPV9 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRAK1Q9UPV9 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRAK1Q9UPV9 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRAK1Q9UPV9 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRAK1Q9UPV9 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRAK1Q9UPV9 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRAK1Q9UPV9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRAK1Q9UPV9 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRAK1Q9UPV9 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRAK1Q9UPV9 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
TRAK1Q9UPV9 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
TRAK1Q9UPV9 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRAK1Q9UPV9 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRAK1Q9UPV9 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRAK1Q9UPV9 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRAK1Q9UPV9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRAK1Q9UPV9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRAK1Q9UPV9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRAK1Q9UPV9 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRAK1Q9UPV9 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRAK1Q9UPV9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRAK1Q9UPV9 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRAK1Q9UPV9 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRAK1Q9UPV9 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRAK1Q9UPV9 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRAK1Q9UPV9 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRAK1Q9UPV9 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
TRAK1Q9UPV9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRAK1Q9UPV9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRAK1Q9UPV9 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRAK1Q9UPV9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRAK1Q9UPV9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRAK1Q9UPV9 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRAK1Q9UPV9 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
TRAK1Q9UPV9 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRAK1Q9UPV9 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRAK1Q9UPV9 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRAK1Q9UPV9 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRAK1Q9UPV9 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRAK1Q9UPV9 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRAK1Q9UPV9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRAK1Q9UPV9 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRAK1Q9UPV9 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRAK1Q9UPV9 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRAK1Q9UPV9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
TRAK1Q9UPV9 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRAK1Q9UPV9 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRAK1Q9UPV9 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRAK1Q9UPV9 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRAK1Q9UPV9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRAK1Q9UPV9 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRAK1Q9UPV9 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms